गंगा के दक्षिणी मैदान में बागमती नदी प्रवाहित नहीं होती है। बिहार की नदियों को तीन भागों में बांटा जा सकता है-

(1) वे नदियाँ जो हिमालय से निकलती हैं और गंगा के उत्तरी मैदान में दक्षिण की ओर बहती हुई गंगा में मिल जाती है, जैसे-सरयू, गण्डक, बूढ़ी, गण्डक, बागमती, कमला, बलान, कोसी तथा महानन्दा।

(2) वे नदियां जो पठार के दक्षिणी भाग से निकलकर उत्तर की ओर बहती हुई गंगा या उसकी सहायक नदियों में बहती है, जैसे-सोन, उत्तरी, कोयल, चानन, पैमार, पुनपुन, फल्गु, सकरी, पंचाने तथा कर्मनाशा नेपाल से निकलकर बिहार में प्रवेश करने वाली बागमती नदी बिहार की खतरनाक नदियों में से एक है। बाढ़ के दिनों में अपना प्रवाह मार्ग बदल लेने वाली यह नदी मुजफ्फरपुर, दरभंगा तथा मधुबनी जिलों में काफी क्षति पहुंचाती है। लालबकिया तथा लखनदेई इसकी प्रमुख सहायक नदियां हैं। पुनपुन नदी मध्यप्रदेश के पठारी भाग से निकलकर पटना के पास फतुहा के समीप गंगा में मिल जाती है।